Les maladies concernées sont les schistosomiases, les géohelminthiases, la lèpre, la rage, la dengue, la leishmaniose, le mycétome, et les envenimassions par morsure de serpents. Tout comme plusieurs autres pays, la Mauritanie se trouve actuellement à un stade où le trachome n'est plus considéré comme un grand problème de santé publique, même s'il subsiste des foyers d'endémicité. Toutefois, un programme de surveillance est aujourd’hui en place. Si aucun nouveau cas n’est signalé, la Mauritanie sera certifié exempt de trachome en juillet 2022